etude de la mortalite bovine en france metropolitaine

141 Pages·2011·5.37 MB·French

by  Virginie Boissad

VETAGRO SUP
CAMPUS VETERINAIRE DE LYON

Année 2011 - Thèse n° 105

ETUDE DE LA MORTALITE BOVINE EN FRANCE
METROPOLITAINE
PAR UNE TRIPLE APPROCHE : BIBLIOGRAPHIQUE, ANALYSE D’UNE
BASE DE DONNEES EXISTANTE ET ENQUETE POSTALE

THESE

Présentée à l’UNIVERSITE CLAUDE-BERNARD - LYON I
(Médecine - Pharmacie)
et soutenue publiquement le 21 décembre 2011
pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire

par

Boissard Virginie
Née le 17 juillet 1983
à Marseille
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ENSEIGNANTS CAMPUS VETERINAIRE DE VETAGRO SUP

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REMERCIEMENTS

A Monsieur le professeur Jacques Fabry de la faculté de Médecine et de Pharmacie de
Lyon pour nous avoir fait l’honneur d’accepter la présidence de notre jury de thèse
Merci de l’intérêt que vous avez porté { notre travail

Au docteur Marie-Anne Arcangioli
De VetAgro Sup
Merci pour votre gentillesse et votre disponibilité

Au docteur Karine Chalvet-Monfray
De Vetagro Sup
Pour avoir accepté de faire partie de notre jury de thèse
Sincères remerciements

Au docteur Didier Calavas
De L’Anses Lyon
Merci de m’avoir donné ma chance !

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REMERCIEMENTS

A mes parents, qui ont tout fait pour que je réussisse mes études.

A ma famille. Petits et grands, j’espère que vous êtes fiers de moi.

Aux amis de l’école véto, Karen, Stéphanie, Claire, Sylvain, Mehdi, Candice, Fofie, et le
groupe de clinique « élargi » Sawsan, Charbel, les RHQ, les FBI, et à ma poulotte
Gersande.

Aux amis de Lyon, Toulouse, Marseille, vieux et moins vieux :
Julien, Céline, Elo, les Flo, Isa, Mag, Alex, Vincent.
A Hilaire et à Corentin.
Aux amis d’ailleurs :
Charles, Musmus, Karine, Julia, Marie-Louise, Francesca, Kamil…

Au docteur Jean-Baptiste Perrin
Merci de m’avoir si bien encadrée, soutenue (et supportée), merci pour tout ce que tu
m’as appris.
Merci pour les échanges débiles par mail et pour avoir laissé le best-of dans la thèse.

Au docteur Emmanuelle Gilot-Fromont
Merci pour votre aide et votre gentillesse

Un grand merci { tous les membres de l’unité Epidémiologie de l’Anses :
Pascal Hendrickx, Emilie Gay, Carole Sala, Eric Morignat, Jean-Luc Vinard, Nathalie Jarrige,
Céline Dupuy, Christelle Philippon, Géraldine Cazeau, Myriam Chazel.
Merci pour votre chaleureux accueil, pour votre aide, et pour les pauses café pendant
lesquelles j’aurais appris beaucoup de choses sur ces êtres mystérieux que sont les
enfants.
Merci pour tous vos coups de main, vos idées, vos conseils, votre gentillesse et vos
gâteaux.
Bien à vous.

Merci également { tous les vétérinaires qui m’ont pris en stage et qui ont contribué d’une
façon ou d’une autre, j’aurais finalement appris beaucoup sur le plan humain { vos cotés.

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Table des matières
INTRODUCTION .................................................................................................................. 15
PARTIE I : ETUDE BIBLIOGRAPHIQUE DE LA MORTALITE BOVINE ............... 17
1 Importance de la mortalité bovine ................................................................................. 19
2 Les différents indicateurs de la mortalité rencontrés dans la littérature ................... 20
2.1 Taux et risque de mortalité 20
2.1.1 Définitions ......................................................................................................................... 20
2.1.2 Hypothèses pour l’estimation du dénominateur ................................................................ 20
2.1.3 Usages dans la littérature ................................................................................................... 21
2.2 Autres indicateurs 21
2.3 Comparabilité 21
3 La mortalité en chiffres dans la littérature ................................................................... 22
3.1 La mortalité des veaux 22
3.2 La mortalité des bovins adultes 23
4 Les facteurs de risque de la mortalité bovine ................................................................ 27
4.1 Les facteurs de risque influençant la mortalité des veaux 27
4.1.1 Facteurs relatifs à la mère .................................................................................................. 27
4.1.2 Facteurs relatifs au veau .................................................................................................... 30
4.1.3 Facteurs relatifs à l’environnement ................................................................................... 31
4.2 Les facteurs de risque influençant la mortalité des bovins adultes 33
4.2.1 Influence de la production laitière ..................................................................................... 33
4.2.2 Facteurs relatifs à l’environnement ................................................................................... 34
4.2.3 Facteurs relatifs à la gestion du troupeau .......................................................................... 35
4.2.4 Facteurs géographiques ..................................................................................................... 36
5 Les causes de mortalité .................................................................................................... 36
5.1 Les causes de mortalité néonatales 36
5.2 Les causes de mortalité post-natale 37
5.3 Les causes de mortalité des bovins adultes 37
6 Conclusion sur l’étude bibliographique ........................................................................ 40
PARTIE II : DESCRIPTION DE LA MORTALITE DES BOVINS ADULTES A
PARTIR DES DONNEES ISSUES DE LA « VISITE DE MORTALITE » ..................... 41
1 Introduction à l’analyse de la base ESB ........................................................................ 43
2 Matériel et méthode ......................................................................................................... 43
2.1 Base de données 43
2.2 Population bovine étudiée 44
2.2.1 Présentation de la région Bretagne .................................................................................... 44
2.2.2 Présentation de la région Basse-Normandie ...................................................................... 45
2.2.3 Présentation de la région Pays de la Loire ......................................................................... 45
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2.3 Outils permettant l’analyse de la base de données 46
2.4 Classification des causes de mort 46
2.4.1 Utilisation du champ « diagnostic » .................................................................................. 46
2.4.2 Les catégories de diagnostic « groupées » et « détaillées » ............................................... 46
2.4.3 Classification : hiérarchisation de cause à effet ................................................................. 47
2.5 Calcul des taux de mortalité 47
3 Résultats et discussion ..................................................................................................... 48
3.1 Caractéristiques de la population bovine morte 48
3.1.1 Type de production ............................................................................................................ 48
3.1.2 Sexe ................................................................................................................................... 48
3.1.3 Âge .................................................................................................................................... 48
3.2 Principales causes de mort 49
3.3 Focus sur certaines catégories 51
3.3.1 Les vêlages difficiles ......................................................................................................... 51
3.3.2 Les mammites .................................................................................................................... 52
3.3.3 Les accidents ..................................................................................................................... 53
3.3.4 Les syndromes entériques .................................................................................................. 53
3.3.5 Les « autres causes » ......................................................................................................... 54
3.3.6 Les causes inconnues ......................................................................................................... 54
3.4 Tendances saisonnières 55
3.5 Une surveillance du cheptel bovin français par la mortalité 56
4 Conclusion ........................................................................................................................ 57
PARTIE III : ETUDE DES CAUSES DE LA MORTALITE BOVINE PAR UNE
ENQUETE POSTALE AUPRES D’ELEVEURS ............................................................... 59
1 Introduction ..................................................................................................................... 61
2 Matériel et méthode ......................................................................................................... 61
2.1 Protocole de l’enquête 61
2.2 Conception des questionnaires 61
2.2.1 Structure générale .............................................................................................................. 61
2.2.2 Question relative aux causes de mortalité ......................................................................... 62
2.2.3 Test des questionnaires ...................................................................................................... 62
2.3 Tirage au sort 62
2.3.1 Base de sondage ................................................................................................................ 62
2.3.2 Stratification de l’échantillon ............................................................................................ 63
2.3.3 Définition des taux de sondage par strate .......................................................................... 63
2.4 Communication 63
2.5 Edition et envoi 64
2.6 Retour et saisie 64
2.7 Gestion des réponses aberrantes et des champs libres 65
3 Résultats et discussion ..................................................................................................... 65
3.1 Description de l’échantillon analysé 66
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