role of benthic amphipods in antarctic trophodynamics

271 Pages·2005·4.43 MB·English

Faculté des Sciences
Département des Sciences et Gestion de l'Environnement
Systématique & Diversité animale

ROLE OF BENTHIC AMPHIPODS IN
ANTARCTIC TROPHODYNAMICS:
A MULTIDISCIPLINARY STUDY

FABIENNE NYSSEN

Dissertation presented in fulfillment for the degree of Doctor of Sciences
2004-2005
Table of contents
CONTENTS

AKNOWLEDGEMENTS
OBJECTIVES...........................................................................…...p.1
CHAPTER 1: General Introduction……………..........…….……..p.5
CHAPTER 2: A stable isotope approach to the eastern Weddell Sea
trophic web: focus on benthic amphipods.
…………………………………………….........………………....p.51
CHAPTER 3: Trophic position of Antarctic amphipods - enhanced
analysis by a 2-dimensional biomarker assay.
…………………………………………….........………………...p.73
CHAPTER 4: Antarctic amphipods feeding habits inferred by gut
contents and mandible morphology.
…………………………………………….........……………......p.105
CHAPTER 5: The crustacean scavenger guild in Antarctic shelf,
bathyal and abyssal communities.
………………………………………….........………………......p.139
CHAPTER 6: Amphipods as food sources for higher trophic levels in
the southern ocean: a synthesis.
…………………………………………….........……………......p.177
CHAPTER 6: General discussion and Conclusions
…………………………………………….........……………......p.191
APPENDIX: Biodiversity of the Southern Ocean: a catalogue of the
Amphipoda
Acknowledgements
Cette recherche a été réalisée dans le laboratoire d’océanologie de l’Université de
Liège ainsi qu’au sein du laboratoire de carcinologie de l’Institut Royal des Sciences
naturelles de Belgique à Bruxelles. Cette double appartenance, bien que peu évidente
à gérer au début sans pour autant me rendre schizo (à Bruxelles: tiens vlà la Liégeoise!
A Liège: tiens vlà la Bruxelloise!...) n’a rendu ce travail que plus riche en expériences
de vie et professionnelles, en rencontres intéressantes et surprenantes, bref, en tout!
Mais le risque d’oublier l’un ou l’autre se voit doublé…

Tout d’abord, je voudrais remercier le Professeur Jean-Marie Bouquegneau qui m’a
accueillie dans son labo au tout début et qui m’a, de ce fait, permis d’accéder aux joies
(et aux peines parfois) de la recherche en océanologie.
Ensuite, c’est avec plaisir que je remercie ceux qui sont derrière cette thèse depuis sa
genèse, mes promoteur et co-promoteur, le Professeur Patrick Dauby et le Dr Claude
DeBroyer.
Claude, merci de m’avoir ouvert les portes de l’Antarctique, ce furent deux
expériences magnifiques qui a elles seules peuvent effacer sans peine les moins bons
côtés d’une thèse et la sueur qu’elle a fait couler sur mon front, sincèrement merci !!
Quant à Patrick, pour m’avoir supportée (au sens propre comme au sens figuré…) sur
terre comme sur mer, pour tes conseils, pour ton humour qui me perdra, pour ton
soutien dans les moments moins comiques, pour le café du matin (!!) et pour tout le
reste, sincèrement MERCI.
I am pleased to thank the Dr Thomas Brey, for all he gave me during this thesis. First
you did contribute by providing me my first Antarctic samples. A bit later, I had the
pleasure to meet you on board Polarstern where I have had the privilege to appreciate
your bitter sense of humour” and your optimism for all situation (Alles wird
sgut!!!!)!!! Maybe my mind will change when I’ll be under your “authority” next
year to carry our Marie Curie Project but I don’t think so… But anyway, THANK
YOU!
All my gratitude will go also to the other “German contribution” to this thesis: the
Professor Gerard Kattner and more particularly, the Dr. Martin Graeve. Thanks to
Acknowledgements
have welcome a messy girl like me in your tidy and so efficient laboratory. I learned
al lot and did appreciate your kindness and your disponibility. Thanks also to Marco
Boer who had “the pleasure” to teach me how to “cook” fatty acids…
To go on with Germany, I’d like to thank those who gave me the opportunities to
meet Antarctica: Prof. Wolf Arntz & Prof. Angelika Brandt. Big thank to all the
Polarstern “Mannschaft” for his professionalism in resolving all tricky situations and
for his kindness.
Numerous places have been a bit as homes for me and I thank here all persons who
made me feel as if I was home: my Polarstern roommate in the Blue Cabin: Katja,
who also welcomed me at her place every time I had to come to Bremen, I am glad to
thank you and your family for the warm atmosphere I had the chance to share. I
would like also to say thank you to all the other German and non German mates I had
the pleasure to share work and to have fun with, from Chile to Antarctica, through
South Africa: Ute, Eva, Kerstin, Felix, Nils, the “Bender team”, Olaf, John, Mike,
Louise, Pedro, Mercedes, Julian (thanks for the wonderful pictures), Fani, Enrique,
Nuria, Casey and the others, without forgetting Dieter Gerdes and his wife Sabine and
Rainer Knust for all they are!!

Après les relations internationales, j’en reviens à ma petite Belgique où j’ai aussi des
tas de gens à remercier.
Pour commencer par l’IRSNB, milliards de milliards de mercis à Pollux et Thierry et
Isa et Gauthier pour avoir fait de mon travail à Bruxelles, un plaisir !!!! Sans oublier
d’ajouter qu’un ami comme toi, Pollo, ça se garde précieusement !! Merci à Henri
pour les dépannages ‘supermégaurgentissimesdedernièreminute’ dans de nombreux
domaines !!! Je remercie aussi tous les membres de l’IRSNB que j’ai eu le plaisir de
côtoyer : Frank, Pico, Françoise, Laurence, Yves, Julien (merci pour les photos au
scan), Ariane, Veerle et bien d’autres encore.

Poursuivons par le labo d’océano où j’ai fait mes premiers pas dans la recherche.
Acknowledgements
Tout d’abord, merci à Gilles pour tous ses conseils, son aide précieuse dans les
analyses, ses expressions bien à lui, sa patience à toute épreuve et sa gentillesse.
Merci à mes deux expat’, ex-collègues préférées : Rachel et Nadège, on a ri ensemble,
on a pleuré aussi ensemble mais, à recommencer, je signe des deux mains. Merci pour
votre amitié !!
Je remercie Sylvie, Krishna, Denis, Virginie, Laure-So, Baptiste (merci pour ton
amitié, ton humour parfois douteux haha et pour les foireux lurons que tu as un peu
partagé avec moi, on s’est bien « piché » comme tu dis…), Marc, les étudiants,
Martine, Isa et Emmanuelle (pour les agréables et comiques pauses de midi) Renzo,
JMT, et les autres membres de la famille océano, pour vos conseils (dans tout
domaine !), votre disponibilité et votre agréable compagnie au laboratoire.

J’en profite car on ne le fait jamais assez dans une vie pour remercier mes parents
pour m’avoir permis d’aboutir, mon frère et ma sœur, pour ce qu’ils m’apportent, ma
famille pour être ma famille et mes amis pour être restés mes amis ;-)

Finalement je voudrais te dire merci Olivier pour tout ce que tu es pour moi, pour tout
ce que tu m’apportes (et tout ce que tu as fait pour alléger ces looooongues dernières
journées ;-)) et pour notre petit J… qui, par son arrivée, malgré les nausées, les kilos
en trop et les coups de pied, m’a donné l’énergie nécessaire pour y arriver....

Ce travail a reçu l’appui financier du Fond de la Recherche pour l’Industrie et
l’Agriculture (FRIA) et des Services Fédéraux pour les affaires Scientifiques
Techniques et Culturelles (SSTC, Programme antarctique, phases IV et V)
OBJECTIVES
Objectives

The purpose of this work is to assess the ecological roles of amphipod
crustaceans in the Southern Ocean and, more particularly, on the continental
shelf of the Weddell Sea and the Antarctic Peninsula.

Within this ecological study, focus has been made on the significance of
amphipods in Antarctic trophodynamics through:

- A systematic determination of gut content composition.
The amphipods have been chosen because they cover an
extremely wide trophic spectrum; from sampling gathering
suspension-feeders such as Ampelisca richardsoni to
micropredators such as Epimeria similis, as well as
scavengers such as Waldeckia obesa. The species
considered in this work are representative of the Antarctic
continental shelf amphipod community.
1
Objectives
- An scan examination of the morphology of the mouthparts
and especially of the mandibles in several species,
representative of different trophic types.
- A systematic analysis of stable isotope ratios -δ13C and
δ15N - in all the sampled species in order to estimate and
compare their respective trophic position. The isotopic
ratios have also been measured in specimens of other
benthic groups to investigate the trophic relationships built
by amphipods in the Antarctic benthic food web.
- The determination of the fatty acid composition in several
species of amphipods to delineate the trophic links between
amphipods and the rest of benthos.

This multidisciplinary approach allows tackling the complex problem of
amphipod trophic role in the Southern Ocean from different angles, each
adding a particular aspect to overall food web picture.

The general introduction and results are presented according to the following
framework:

Chapter 1: A general introduction puts the scientific question in its global
context by summarizing information about the studied ecosystem: the
Southern Ocean and the significance of amphipods in Antarctic benthic
communities. The second part of this introduction is devoted to the
description of the different techniques that have been used to assess benthic
amphipod ecological role in Antarctic trophodynamics.

Some of the following chapters have already been published in peer-review
journals or submitted.

2
Objectives
Chapter 2: “A stable isotope approach to the Eastern Weddell Sea trophic
web: focus on benthic amphipods”, Polar Biology (2002) 25: 280-287.
Chapter 3: “Trophic position of Antarctic amphipods - enhanced analysis by
a 2-dimensional biomarker assay”, Marine Ecology Progress Series, (2005)
in press.

Chapter 4: “Antarctic amphipod feeding habits inferred from gut contents
and mandible morphology”, to be submitted.

Chapter 5: “The crustacean scavenger guild in Antarctic shelf, bathyal and
abyssal communities” Deep-Sea Research, part II (2004) 51: 1733-1752.

Chapter 6: “Amphipods as food sources for higher trophic levels in the
Southern Ocean: a synthesis”, In: Huiskes AHL, Gieskes WWC, Rozema J,
Schorno RML, van der Vies SM, Wolff WJ (eds) Antarctic Biology in a
Global Context. Backhuys Publ, Leiden, (2003) p 129-134.

Chapter 7: General Discussion and Conclusions.

3
CHAPTER 1: GENERAL INTRODUCTION