Paola Andrea Ortiz Vargas

171 Pages·2014·9.27 MB·Portuguese

Genes de cisteíno-proteases de tripanossomas de mamíferos: Polimorfismo e relações filogenéticas 0

Paola Andrea Ortiz Vargas

GENES DE CISTEÍNO-PROTEASES DE
Trypanosoma spp. DE MAMÍFEROS: POLIMORFISMO E
RELAÇÕES FILOGENÉTICAS

Tese apresentada ao Programa de Pós-
Graduação em Biologia da Relação
Patógeno-Hospedeiro do Instituto de
Ciências Biomédicas da Universidade de
São Paulo, para obtenção do Título de
Doutor em Ciências Biológicas.

São Paulo
2014
Genes de cisteíno-proteases de tripanossomas de mamíferos: Polimorfismo e relações filogenéticas 1

Paola Andrea Ortiz Vargas

GENES DE CISTEÍNO PROTEASES DE
Trypanosoma spp. DE MAMÍFEROS: POLIMORFISMO E
RELAÇÕES FILOGENÉTICAS

Tese apresentada ao Programa de Pós-
Graduação em Biologia da Relação Patógeno-
Hospedeiro do Instituto de Ciências Biomédicas da
Universidade de São Paulo, para obtenção do
Título de Doutor em Ciências Biológicas.

Área de Concentração:
Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro

Orientadora: Profa. Dra. Marta M. G. Teixeira

Versão original

São Paulo
2014
DADOS DE CATALOGAÇÃO NA PUBLICAÇÃO (CIP)
Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica do
Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo
reprodução não autorizada pelo autor

Vargas, Paola Andrea Ortiz.
Genes de cisteíno-proteases de tripanossomas de mamíferos:
polimorfismo e relações filogenéticas / Paola Andrea Ortiz Vargas. --
São Paulo, 2014.

Orientador: Profa. Dra. Marta Maria Geraldes Teixeira.

Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo. Instituto de Ciências
Biomédicas. Departamento de Parasitologia. Área de concentração:
Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro. Linha de pesquisa:
Taxonomia e filogenia molecular de tripanossomatídeos.

Versão do título para o inglês: Cysteine protease gene from
trypanosomes of mammals: polymorphism and phylogenetic
relationships .

1. Trypanosoma spp. 2. Cisteíno-proteases 3. Filogenia
4. Genotipagem de tripanossomas 5. Catepsina L-Like 6. Catepsina
B-Like I. Teixeira, Profa. Dra. Marta Maria Geraldes II. Universidade
de São Paulo. Instituto de Ciências Biomédicas. Programa de Pós-
Graduação em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro III. Título.

ICB/SBIB041/2014
UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO
INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS
______________________________________________________________________________________________________________
Candidato(a): Paola Andrea Ortiz Vargas.
Título da Tese: Genes de cisteíno-proteases de tripanossomas de
mamíferos: Polimorfismo e relações filogenéticas.
Orientador(a): Profa. Dra. Marta Maria Geraldes Teixeira.
A Comissão Julgadora dos trabalhos de Defesa da Tese de Doutorado, em sessão
pública realizada a ................./................./................., considerou
( ) Aprovado(a) ( ) Reprovado(a)
Examinador(a): Assinatura: ...............................................................................................
Nome: .......................................................................................................
Instituição: ................................................................................................
Examinador(a): Assinatura: ................................................................................................
Nome: .......................................................................................................
Instituição: ................................................................................................
Examinador(a): Assinatura: ................................................................................................
Nome: .......................................................................................................
Instituição: ................................................................................................
Examinador(a): Assinatura: ................................................................................................
Nome: .......................................................................................................
Instituição: ................................................................................................
Presidente: Assinatura: ................................................................................................
Nome: .......................................................................................................
Instituição: ................................................................................................
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A Deus, por ter sido TUDO: Meu abrigo, companhia, fortaleça, consolo,
esperança, paz, sustento, alegria e AMOR durante todos estes anos... Especialmente

naqueles mais difíceis.

Ao meu PAI Eduardo, pelo seu imenso amor, pelo exemplo de luta e

perseverança, por cada sacrifício feito para que nada me faltasse e por apoiar meus

sonhos, mesmo sabendo que eles me levariam longe de casa.

A minha MÃE Luz Marina, pelo seu amor insondável, pela sua presença

constante a pesar da distância, pelo apoio, pelo exemplo de integridade, pelas suas

orações e pelo seu colo que sempre terá o tamanho das minhas necessidades.

Aos meus amores Camilo e Javier, esses que costumo chamar de

IRMÃOS, pelo carinho, pela amizade, pela cumplicidade e por todos os anos de

felicidade que temos dividido juntos sem importar quão longe possamos estar um do
outro.
Genes de cisteíno-proteases de tripanossomas de mamíferos: Polimorfismo e relações filogenéticas. 6
AGRADECIMENTOS

A Profa. Dra. Marta Maria Geraldes Teixeira, não apenas pela excelente orientação e grandes
ensinamentos que tenho recebido ao longo de todos esses anos, mas também pela confiança no meu
trabalho, pelo incentivo constante, pela dedicação em cada fase da minha formação e pelo apoio
incondicional que tenho recebido desde que a conheci. Obrigada por me ajudar a construir mais um degrau
e conquistar mais um sonho. Somente quero dizer, muito obrigada por TUDO.

Ao Prof. Dr. Erney Felício Plessmann de Camargo, pelo exemplo de paixão e dedicação naquilo
que chamamos de “pesquisa”, pelo estímulo constante, pelas coisas incríveis que aprendemos da sua
experiência e pelas valiosas contribuições para o desenvolvimento dos nossos trabalhos.

A Profa. Dra. Silvia Celina Alfieri, pelo cuidado e dedicação na revisão deste documento, pelos
diversos ensinamentos que tenho recebido desde a época do meu mestrado e pelas valiosas contribuições
em cada um dos trabalhos aqui apresentados.

A Marta Campaner, pelo apoio técnico fundamental no desenvolvimento de cada um dos trabalhos
concluídos, também pelos cuidados e pela acolhida que tive quando cheguei ao laboratório.

A Carmen Silvia Takata, minha querida Dona Carmen, pelo apoio incalculável em todas as etapas
da minha formação, pelos valiosos ensinamentos no dia a dia, pela paciência de todos esses anos e
disposição para resolver muitos dos nossos problemas cotidianos. Mas acima de todo, eu quero agradecer
pelo afeto, confiança e carinho que tenho recebido sempre.

A Dra. Flavia Maia da Silva, em primeiro lugar, pelos ensinamentos que recebi durante muitos
anos, pela paciência e pelo exemplo de disciplina no trabalho. Em segundo lugar, pela amizade, pelo
carinho e pelas divertidas jornadas de aprendizado que tive do seu lado.

A Dra. Adriana Carlos Rodrigues, pelo exemplo de profissionalismo, pelas orientações sempre
acertadas nos diversos procedimentos experimentais, por todas as contribuições feitas à minha formação,
pelas eternas discussões em relação às nossas queridas proteínas e finalmente pelo carinho, apoio,
amizade e respaldo que sempre encontrei do seu lado.

A Dra. Luciana Lima pela valiosa ajuda e importantes contribuições nas diferentes fases do meu
trabalho, especialmente nesta última, tão corrida. Fico muito agradecida com cada detalhe que você
resolveu por mim, com todo cuidado e dedicação. Também pela amizade sincera, pelo carinho e
companheirismo que você tem me oferecido desde a minha chegada ao Brasil.

A minha amiga, irmã e companheira de aventuras Maria Oneida, sei que sem você do meu lado
tudo teria ficado mais difícil e bem menos divertido. Obrigada pela tua bondade e apoio incondicional.
Obrigada por todas as coisas que você tem feito por mim (que não são poucas e muito menos simples) e
também pela ajuda incalculável na finalização deste trabalho.

Aos meus queridos André, Carla e Tarcilla, pelo apoio oportuno e preciosa ajuda nos momentos
mais importantes. Agradeço ainda a cada um de vocês pelo carinho sincero, pela amizade incondicional e
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pelos momentos divertidos que tenho vivido com vocês em meio aos momentos de estresse. Estou muito
agradecida com vocês.

Aos meus amigos do laboratório Andernice, Bruno, Herakles, Jennifer, João Marcelo, Juliana,
Lyslaine, Omar, Robson, Tania e Zuleima, pelo companheirismo e por tudo que tenho aprendido com cada
um de vocês.

Aos professores doutores Alejandro Miguel Katzin e Silvia Reni Bortolin Uliana pelo empréstimo de
diversos equipamentos e reagentes necessários em algumas fases deste trabalho e também pela
colaboração oportuna sempre que necessário.

Aos meus queridos amigos do departamento, Adriano, Jordana, Cristiana, Juliana, pela amizade e
carinho sincero que temos desenvolvido nesses últimos tempos. Pelos almoços tão divertidos que sem
dúvida têm sido os melhores momentos de descontração durante as longas jornadas de trabalho.

As minhas queridas amigas colombianas, Lina Maria, Alejandra, Danielle, Eliana e Carolina, pela
amizade, apoio, ânimo, confiança e carinho que tenho recebido de todas vocês.

A todos os professores do departamento que contribuíram para a minha formação e estiveram
sempre dispostos a resolver diferentes dúvidas quando necessário.

A Marinete P. da Silva, pelo suporte e assistência técnicos indispensáveis para o desenvolvimento
dos nossos experimentos.

Ao Márcio M. Yamamoto pelo suporte e auxilio oportunos no sequenciamento de grande parte das
amostras compiladas neste trabalho.

Finalmente a minha família, aos meus pais por entender minha ausência, por respaldar meus
sonhos e todas as minhas decisões sem importar quão longe elas me levam de casa. Aos meus irmãos
Camilo e Javier, aos meus sobrinhos Vanessa e Alejandro por estarem pressentes cada instante da minha
vida. A minha querida vovó pelo seu insondável amor, pelas suas orações e por todos os cuidados que
ainda de longe continuo a sentir.

Aos meus queridos pais espirituais, Miguel, Heydis e Belkis, pelo amor incondicional, pelo carinho
que tem depositado em mim, pelas inúmeras orações que me acompanham no dia a dia e porque do seu
lado entendo que Deus me deu uma linda família também no Brasil.
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A maravilhosa disposição e harmonia do universo só pode
ter tido origem segundo o plano de um Ser que tudo sabe e
tudo pode. Isso fica sendo a minha última e mais elevada
descoberta.
Isaac Newton
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Este trabalho contou com apoio financeiro do Conselho
Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq),
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
(CAPES).